Nathalie Vergnolle

Céline Deraison

Programmes de recherche

L’objectif général de l’équipe « Gut Protease Signals » est de comprendre les mécanismes des maladies associées aux dysfonctionnements de l’épithélium intestinal : les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), le syndrome de l’intestin irritable (SII), le cancer colorectal et les infections. L’équipe possède une expertise en biologie de la muqueuse intestinale, notamment dans ses fonctions de barrière, ses fonctions sécrétoires, l’absorption, la régénération, le contrôle neuronal de la sécrétion et de la motricité, la nociception intestinale et la douleur viscérale, ainsi que les interactions entre l’hôte, le microbiote et les pathogènes.

L’étude de l’équilibre protéolytique muqueux dans la physiologie et les pathologies intestinales constitue un axe de recherche clé. Certaines activités protéolytiques ont été identifiées comme dérégulées dans divers contextes pathophysiologiques, et ces protéases font désormais l’objet d’investigations approfondies pour élucider leur rôle dans la pathogénie. L’implication des récepteurs activés par les protéases (PAR) dans les pathologies digestives représente une thématique historique et majeure pour l’équipe.

Par ailleurs, l’équipe s’intéresse à l’influence du genre et de l’âge sur les pathologies découlant d’altérations des cryptes intestinales. La douleur associée à l’organe intestinal est également un axe important de recherche, avec une investigation des mécanismes d’hypersensibilité viscérale, dans le but de proposer de nouvelles options thérapeutiques pour le traitement de la douleur et de l’inconfort viscéraux. Une attention particulière est portée sur les relations entre les médiateurs épithéliaux, immunitaires et microbiens dans la transmission des signaux nociceptifs, afin de mieux comprendre la complexité des signaux périphériques impliqués dans la douleur aiguë et chronique au niveau intestinal.

Des partenariats solides ont été établis avec l’industrie pharmaceutique pour développer des molécules thérapeutiques ciblant les médiateurs identifiés pour leur rôle pathogène dans les maladies intestinales.

People

Nathalie Vergnolle
Chercheur

Agnès Wiedemann
Chercheur

Amandine Dupuis
IE

Anissa Edir
IE

Beatriz Hernandez-Suarez
Posdoc

Céline Deraison
Chercheur

Chrystelle Bonnart
Chercheur

Claire Racaud
Chercheur

Corine Rolland
IE

Etienne Buscail
PU-PH

Jean-Paul Motta
Chercheur

Julie Thevenin
IE

Laura Guiraud
IE

Romain Gauthier
Doctorant

Sofia Faggin
Posdoc

Outils et modeles

• Modèles d’organoïdes humains et murins : Les organoïdes permettent de recréer in vitro, en trois dimensions, une monocouche épithéliale intestinale, incluant la diversité complète des cellules épithéliales intestinales tout en préservant l’architecture tissulaire. Ces modèles in vitro sont des outils puissants pour la recherche fondamentale en physiologie et pathophysiologie intestinale, ainsi que pour le développement thérapeutique. Nous utilisons des modèles d’organoïdes dérivés du côlon et de l’intestin grêle, à partir de tissus de témoins sains ou de patients, en culture tridimensionnelle ou en transwells (cultures d’organoïdes en interface avec le microbiote et les cellules immunitaires).
• Lignes cellulaires épithéliales intestinales humaines et murines
• Évaluation in vitro et in vivo de la fonction barrière de l’épithélium intestinal
• Modèles animaux de maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (DSS, TNBS, oxazolone)
• Modèles animaux du syndrome de l’intestin irritable (dérivés de tissus de patients, stress, post-infectieux)
• Modèles d’infection bactérienne (Salmonella, Pseudomonas)
• Modèles de culture de biofilms et études du microbiote intestinal
• Modèles animaux d’hypersensibilité viscérale et mesures de la douleur viscérale
• Modèles animaux de cancer colorectal
• Modèles d’iléus postopératoire
• Biochimie des protéases: production, mesure de l’activité protéolytique, profilage de la sonde à base d’activité
• Récepteurs activés par la protéase (PAR) : souris knock-out, lignées cellulaires transgéniques, lignées cellulaires modifiées par CRISPR-Cas9, antagonistes pharmacologiques
• Souris transgéniques surexprimant des protéases (élastase, trypsine-3) et souris déficientes pour l’expression de certaines protéases

Publications