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CONTACTS
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PLATEFORME " ORGANOÏDES "
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Technics:
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Recherche
Développement et analyse de primocultures d’organoïdes 3D.
La mise en place de modèles d’organoïdes 3D à partir de tissus murins et humains a été une avancée majeure durant la dernière décennie. Ces modèles sont basés sur les capacités des cellules souches d’un tissu à renouveller les diverses populations cellulaires le constituant.
Les cellules souches ont besoin d’une niche microenvironnementale unique. Ainsi, une fois en présence d’une combinaison spécifiques de facteurs et incorporées dans une matrice 3D reconstituant cette niche, les tissus épitheliaux murins et humains peuvent former des organoïdes. Ceci a été décrit pour différents organes, comme l’estomac, l’intestin grêle, le colon, le pancréas, le foie et la vessie, (Barker et al., 2010; Boj et al., 2015; Huch et al., 2013; Sato et al., 2011; Varley CL et al., 2011).
Ces modèles d’organoïdes 3D représentent un grand interêt à la fois pour la recherche fondammentale et translationnelle.
Ce type de culture de mini-organe peut être appliquée à des tissus sains ou pathologiques ( inflammation et cancer ). Pendant la tumorigènese, par exemple, les facteurs de niche deviennent souvent inutiles conduisant à des conditions de culture moins stringentes pour les organoïdes tumoraux par rapport à des organoïdes «normaux». Les organoïdes cancéreux établis peuvent être xenotransplantés afin de récapituler l’histopathologie de la tumeur parentale dont ils sont derivés. Il a été montré que les organoïdes cancéreux reflètent les lésions génétiques et les profils d’expression génique, ouvrant la possibilité de tester des médicaments afin de prédire les réponses des patients à des traitements cliniques.
Ainsi, établir une biobanque d’organoïdes dérivés de tissus sains/normaux et pathologiques pourra aider à appréhender la pathogénèse et développer de nouveaux outils de diagnostic et thérapeutiques. Notre institut met actuellement en place ce genre de banque à partir des tissus coliques sains, et de tissus issus de patients atteints de maladies inflammatoires chroniques de l’intestin et de cancers.
La mise en place de modèles d’organoïdes 3D à partir de tissus murins et humains a été une avancée majeure durant la dernière décennie. Ces modèles sont basés sur les capacités des cellules souches d’un tissu à renouveller les diverses populations cellulaires le constituant.
Les cellules souches ont besoin d’une niche microenvironnementale unique. Ainsi, une fois en présence d’une combinaison spécifiques de facteurs et incorporées dans une matrice 3D reconstituant cette niche, les tissus épitheliaux murins et humains peuvent former des organoïdes. Ceci a été décrit pour différents organes, comme l’estomac, l’intestin grêle, le colon, le pancréas, le foie et la vessie, (Barker et al., 2010; Boj et al., 2015; Huch et al., 2013; Sato et al., 2011; Varley CL et al., 2011).
Ces modèles d’organoïdes 3D représentent un grand interêt à la fois pour la recherche fondammentale et translationnelle.
Ce type de culture de mini-organe peut être appliquée à des tissus sains ou pathologiques ( inflammation et cancer ). Pendant la tumorigènese, par exemple, les facteurs de niche deviennent souvent inutiles conduisant à des conditions de culture moins stringentes pour les organoïdes tumoraux par rapport à des organoïdes «normaux». Les organoïdes cancéreux établis peuvent être xenotransplantés afin de récapituler l’histopathologie de la tumeur parentale dont ils sont derivés. Il a été montré que les organoïdes cancéreux reflètent les lésions génétiques et les profils d’expression génique, ouvrant la possibilité de tester des médicaments afin de prédire les réponses des patients à des traitements cliniques.
Ainsi, établir une biobanque d’organoïdes dérivés de tissus sains/normaux et pathologiques pourra aider à appréhender la pathogénèse et développer de nouveaux outils de diagnostic et thérapeutiques. Notre institut met actuellement en place ce genre de banque à partir des tissus coliques sains, et de tissus issus de patients atteints de maladies inflammatoires chroniques de l’intestin et de cancers.
Production scientifique
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1: Buscail E, Planchamp T, Le Cosquer G, Bouchet M, Thevenin J, Carrere N,
Muscari F, Abbo O, Maulat C, Weyl A, Duffas JP, Philis A, Ghouti L, Canivet C, Motta JP, Vergnolle N, Deraison C, Shourick J. Postoperative ileus after digestive surgery: Network meta-analysis of pharmacological intervention. Br J Clin Pharmacol. 2023 Aug 9. doi: 10.1111/bcp.15878. Epub ahead of print. PMID: 37559444. 2: Piquemal D, Bruno R, Bournet B, Ghiringhelli F, Noguier F, Canivet C, Bertaut A, Pierrat F, Evesque L, Gamez A, Cros J, Rederstorff E, Petit E, Adnet J, Saint A, Drouillard A, Kempf E, Soularue E, Vincent J, Baumgaertner I, Hennequin A, Tournigand C, Lopez Trabada Ataz D, Bengrine L, Lepage C, Manfredi S, Afchain P, Trouilloud I, Gagnaire A, LoConte NK, Bachet JB. Performance of a blood-based RNA signature for gemcitabine-based treatment in metastatic pancreatic adenocarcinoma. J Gastrointest Oncol. 2023 Apr 29;14(2):997-1007. doi: 10.21037/jgo-22-946. Epub 2023 Apr 10. PMID: 37201091; PMCID: PMC10186541. 3: Buscail L, Culetto A, Mokhrane FZ, Napoléon B, Meyrignac O, Molinier B, Lebrin M, Bournet B, Bérard E, Canivet C. Endoscopic ultrasound as a reliable tool for assessment of pancreatic adenocarcinoma treatment: Example of in situ gene therapy. Endosc Int Open. 2022 Jun 10;10(6):E910-E916. doi: 10.1055/a-1799-7774. PMID: 35692905; PMCID: PMC9187414. 4: Buscail E, Canivet C, Ghouti L, Kirzin S, Carrere N, Molinier L, Rosillo A, Lauwers-Cances V, Costa N; French Research Group of Rectal Cancer Surgery (GRECCAR Group). Randomised clinical trial for the cost-utility evaluation of two strategies of perineal reconstruction after abdominoperineal resection in the context of anorectal carcinoma: biological mesh repair versus primary perineal wound closure, study protocol for the GRECCAR 9 Study. BMJ Open. 2021 Apr 1;11(4):e043333. doi: 10.1136/bmjopen-2020-043333. PMID: 33795299; PMCID: PMC8021762. 5: Buscail E, Canivet C, Shourick J, Chantalat E, Carrere N, Duffas JP, Philis A, Berard E, Buscail L, Ghouti L, Chaput B. Perineal Wound Closure Following Abdominoperineal Resection and Pelvic Exenteration for Cancer: A Systematic Review and Meta-Analysis. Cancers (Basel). 2021 Feb 10;13(4):721. doi: 10.3390/cancers13040721. PMID: 33578769; PMCID: PMC7916499. 6: Frere C, Crichi B, Bournet B, Canivet C, Abdallah NA, Buscail L, Farge D. Primary Thromboprophylaxis in Ambulatory Pancreatic Cancer Patients Receiving Chemotherapy: A Systematic Review and Meta-Analysis of Randomized Controlled Trials. Cancers (Basel). 2020 Jul 24;12(8):2028. doi: 10.3390/cancers12082028. PMID: 32722064; PMCID: PMC7464699. 7: Nicolle R, Blum Y, Duconseil P, Vanbrugghe C, Brandone N, Poizat F, Roques J, Bigonnet M, Gayet O, Rubis M, Elarouci N, Armenoult L, Ayadi M, de Reyniès A, Giovannini M, Grandval P, Garcia S, Canivet C, Cros J, Bournet B, Buscail L; BACAP Consortium; Moutardier V, Gilabert M, Iovanna J, Dusetti N. Establishment of a pancreatic adenocarcinoma molecular gradient (PAMG) that predicts the clinical outcome of pancreatic cancer. EBioMedicine. 2020 Jul;57:102858. doi: 10.1016/j.ebiom.2020.102858. Epub 2020 Jul 3. PMID: 32629389; PMCID: PMC7334821. 8: Grellety T, Ravaud A, Canivet A, Ganem G, Giraud P, Guimbaud R, Kaluzinski L, Krakowski I, Mayeur D, Lotz JP, You B. Infection à SARS-CoV-2/COVID 19 et cancers solides : synthèse des recommandations à l’attention des professionnels de santé [SARS-CoV-2/COVID 19 Infection and Solid Cancers: Synthesis of Recommendations for Health Professionals]. Bull Cancer. 2020 Apr;107(4):400-402. French. doi: 10.1016/j.bulcan.2020.03.001. Epub 2020 Mar 27. PMID: 32229048; PMCID: PMC7195419. 9: You B, Ravaud A, Canivet A, Ganem G, Giraud P, Guimbaud R, Kaluzinski L, Krakowski I, Mayeur D, Grellety T, Lotz JP. The official French guidelines to protect patients with cancer against SARS-CoV-2 infection. Lancet Oncol. 2020 May;21(5):619-621. doi: 10.1016/S1470-2045(20)30204-7. Epub 2020 Mar 25. PMID: 32220659; PMCID: PMC7118635. 10: Maulat C, Canivet C, Touraine C, Gourgou S, Napoleon B, Palazzo L, Flori N, Piessen G, Guibert P, Truant S, Assenat E, Buscail L, Bournet B, Muscari F, The Bacap Consortium. A New Score to Predict the Resectability of Pancreatic Adenocarcinoma: The BACAP Score. Cancers (Basel). 2020 Mar 25;12(4):783. doi: 10.3390/cancers12040783. PMID: 32218346; PMCID: PMC7226323. 11: Frere C, Bournet B, Gourgou S, Fraisse J, Canivet C, Connors JM, Buscail L, Farge D; BACAP Consortium. Incidence of Venous Thromboembolism in Patients With Newly Diagnosed Pancreatic Cancer and Factors Associated With Outcomes. Gastroenterology. 2020 Apr;158(5):1346-1358.e4. doi: 10.1053/j.gastro.2019.12.009. Epub 2019 Dec 14. PMID: 31843588. 12: Canivet C, Gourgou-Bourgade S, Napoléon B, Palazzo L, Flori N, Guibert P, Piessen G, Farges-Bancel D, Seitz JF, Assenat E, Vendrely V, Truant S, Vanbiervliet G, Berthelémy P, Garcia S, Gomez-Brouchet A, Buscail L, Bournet B; BACAP Consortium. A prospective clinical and biological database for pancreatic adenocarcinoma: the BACAP cohort. BMC Cancer. 2018 Oct 16;18(1):986. doi: 10.1186/s12885-018-4906-4. PMID: 30326968; PMCID: PMC6191891. 13: Legrand FD, Albinet C, Canivet A, Gierski F, Morrone I, Besche-Richard C. Brief aerobic exercise immediately enhances visual attentional control and perceptual speed. Testing the mediating role of feelings of energy. Acta Psychol (Amst). 2018 Nov;191:25-31. doi: 10.1016/j.actpsy.2018.08.020. Epub 2018 Sep 5. PMID: 30195178. 14: Anty R, Favre G, Coilly A, Rossignol E, Houssel-Debry P, Duvoux C, De Ledinghen V, Di Martino V, Leroy V, Radenne S, Kamar N, Canva V, D'Alteroche L, Durand F, Dumortier J, Lebray P, Besch C, Tran A, Canivet CM, Botta-Fridlund D, Montialoux H, Moreno C, Conti F, Silvain C, Perré P, Habersetzer F, Abergel A, Debette-Gratien M, Dharancy S, Esnault VLM, Fougerou-Leurent C, Cagnot C, Diallo A, Veislinger A, Danjou H, Samuel D, Pageaux GP, Duclos-Vallée JC; ANRS CO23 CUPILT Study Group. Safety of sofosbuvir-based regimens after liver transplantation: longitudinal assessment of renal function in the prospective ANRS CO23 CUPILT study. Aliment Pharmacol Ther. 2018 Jun;47(12):1682-1689. doi: 10.1111/apt.14639. Epub 2018 Apr 17. PMID: 29665081. 15: Rey-Barroso J, Calovi DS, Combe M, German Y, Moreau M, Canivet A, Wang X, Sire C, Theraulaz G, Dupré L. 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The β and α2δ auxiliary subunits of voltage-gated calcium channel 1 (Ca<sub>v</sub>1) are required for T<sub>H</sub>2 lymphocyte function and acute allergic airway inflammation. J Allergy Clin Immunol. 2018 Sep;142(3):892-903.e8. doi: 10.1016/j.jaci.2017.09.045. Epub 2017 Nov 10. PMID: 29129580. 19: Canivet C, Costa N, Ory-Magne F, Arcari C, Mohara C, Pourcel L, Derumeaux H, Bérard E, Bourrel R, Molinier L, Brefel-Courbon C. Clinical Impact and Cost- Effectiveness of an Education Program for PD Patients: A Randomized Controlled Trial. PLoS One. 2016 Sep 29;11(9):e0162646. doi: 10.1371/journal.pone.0162646. PMID: 27685455; PMCID: PMC5042480. 20: Bernard-Valnet R, Yshii L, Quériault C, Nguyen XH, Arthaud S, Rodrigues M, Canivet A, Morel AL, Matthys A, Bauer J, Pignolet B, Dauvilliers Y, Peyron C, Liblau RS. CD8 T cell-mediated killing of orexinergic neurons induces a narcolepsy-like phenotype in mice. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Sep 27;113(39):10956-61. doi: 10.1073/pnas.1603325113. Epub 2016 Sep 12. PMID: 27621438; PMCID: PMC5047186. 21: Thévenot T, Briot C, Macé V, Lison H, Elkrief L, Heurgué-Berlot A, Bureau C, Jézéquel C, Riachi G, Louvet A, Pauwels A, Ollivier-Hourmand I, Anty R, Carbonell N, Labadie H, Aziz K, Grasset D, Nguyen-Khac E, Kaassis M, Hermann S, Tanné F, Mouillot T, Roux O, Le Thuaut A, Cervoni JP, Cadranel JF, Schnee M; CFEHTP, ANGH and the PerDRISLA study group. The Periscreen Strip Is Highly Efficient for the Exclusion of Spontaneous Bacterial Peritonitis in Cirrhotic Outpatients. Am J Gastroenterol. 2016 Oct;111(10):1402-1409. doi: 10.1038/ajg.2016.344. Epub 2016 Sep 13. PMID: 27619833. 22: El Mourdi I, Canivet A, Joncker NT, Bellard E, Allart S. High accuracy 4D cell tracking into explanted skin using two-photon excitation microscopy. Microsc Res Tech. 2015 Apr;78(4):294-301. doi: 10.1002/jemt.22474. Epub 2015 Feb 8. PMID: 25663489. 23: Pellaprat J, Ory-Magne F, Canivet C, Simonetta-Moreau M, Lotterie JA, Radji F, Arbus C, Gerdelat A, Chaynes P, Brefel-Courbon C. Deep brain stimulation of the subthalamic nucleus improves pain in Parkinson's disease. Parkinsonism Relat Disord. 2014 Jun;20(6):662-4. doi: 10.1016/j.parkreldis.2014.03.011. Epub 2014 Mar 20. PMID: 24685343. 24: Ory Magne F, Arcari C, Canivet C, Sarrail M, Fabre MH, Mohara C, Brefel Courbon C. Éducation thérapeutique chez le patient parkinsonien: le programme ETPARK [A therapeutic educational program in Parkinson's disease: ETPARK]. Rev Neurol (Paris). 2014 Feb;170(2):128-33. French. doi: 10.1016/j.neurol.2013.08.007. Epub 2013 Nov 20. PMID: 24267951. 25: Galvani S, Augé N, Calise D, Thiers JC, Canivet C, Kamar N, Rostaing L, Abbal M, Sallusto F, Salvayre R, Böhler T, Zou Y, Stastny P, Nègre-Salvayre A, Thomsen M. HLA class I antibodies provoke graft arteriosclerosis in human arteries transplanted into SCID/beige mice. 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PMID: 19446045. 28: Böhler T, Kamar N, Etienne L, Galvani S, Canivet C, Thomsen M, Salvayre R, Nègre-Salvayre A, Rostaing L, Auge N. FTY720 Inhibits Tumor Necrosis Factor- alpha-Induced Proliferation and Extracellular Signal-Regulated Kinase Phosphorylation of Human Smooth Muscle Cells. Transplant Proc. 2009 Mar;41(2):705-6. doi: 10.1016/j.transproceed.2008.12.017. PMID: 19328962. 29: Böhler T, Canivet C, Nguyen PN, Galvani S, Thomsen M, Durand D, Salvayre R, Negre-Salvayre A, Rostaing L, Kamar N. Cytokines correlate with age in healthy volunteers, dialysis patients and kidney-transplant patients. Cytokine. 2009 Mar;45(3):169-73. doi: 10.1016/j.cyto.2008.11.014. Epub 2009 Jan 14. PMID: 19147373. 30: Canivet C, Böhler T, Galvani S, Therville N, Salvayre R, Durand D, Thomsen M, Rostaing L, Kamar N. T-cell function in maintenance renal transplant patients receiving mycophenolate mofetil and steroids with or without tacrolimus. Transplant Proc. 2008 Dec;40(10):3422-3. doi: 10.1016/j.transproceed.2008.06.062. PMID: 19100403. 31: Canivet C, Böhler T, Galvani S, Péron JM, Muscari F, Alric L, Barange K, Salvayre R, Negre-Salvayre A, Durand D, Suc B, Izopet J, Thomsen M, Rostaing L, Kamar N. In vitro mitogen-stimulated T-cell from hepatitis C virus-positive liver transplantation candidates, increases T-cell activation markers and T-cell proliferation. Transpl Immunol. 2008 May;19(2):112-9. doi: 10.1016/j.trim.2008.03.001. Epub 2008 Apr 3. PMID: 18503886. 32: Böhler T, Canivet C, Galvani S, Therville N, Salvayre R, Negre-Salvayre A, Durand D, Thomsen M, Rostaing L, Kamar N. Pharmacodynamic monitoring of the conversion from mycophenolate mofetil to enteric-coated mycophenolate sodium in stable kidney-allograft recipients. Int Immunopharmacol. 2008 May;8(5):769-73. doi: 10.1016/j.intimp.2008.01.023. Epub 2008 Feb 20. PMID: 18387521. 33: Thomsen M, Galvani S, Canivet C, Kamar N, Böhler T. Reconstitution of immunodeficient SCID/beige mice with human cells: applications in preclinical studies. Toxicology. 2008 Apr 3;246(1):18-23. doi: 10.1016/j.tox.2007.10.017. Epub 2007 Oct 26. PMID: 18055093. 34: Böhler T, Guillebaud J, Etienne L, Canivet C, Kamar N, Rostaing L, Thiers JC, Galvani S, Augé N, Salvayre R, Nègre-Salvayre A, Thomsen M. Effect of FTY720 on apoptosis of smooth muscle cells. Transplant Proc. 2007 Oct;39(8):2624-6. doi: 10.1016/j.transproceed.2007.08.012. PMID: 17954194. |
