PUBLICATION : ​Deciphering the interplay between the genotoxic and probiotic activities of Escherichia coli Nissle 1917, Plos Pathogen

PUBLICATION & Front Cover: A Two‐Week Treatment with Plant Extracts Changes Gut Microbiota, Caecum Metabolome, and Markers of Lipid Metabolism in ob/ob Mice

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In article number 1900403, Matteo Serino and co‐workers find that in ob/ob mice, a two week treatment with plant extracts affects gut microbiota, caecum metabolome, markers of plasma lipid metabolism, as well as white adipose tissue and liver gene expression. These findings are depending on both the nature and dose of the tested extract.
​Les prébiotiques sont, à l’heure actuelle, un des traitements privilégiés de certaines maladies métaboliques, puisqu’ils restaurent l’équilibre du microbiote lorsque celui-ci dysfonctionne et améliorent le métabolisme de l’organisme. Ces molécules nécessitent cependant d’être utilisées à des doses élevées, ce qui peut générer ballonnements et flatulences chez les patients. Une équipe de recherche dirigée par Matteo Serino, chercheur Inserm au sein de l’Institut de recherche en santé digestive (Inserm/Inra/ENVT/UT3 Paul Sabatier), vient de mettre en évidence chez des souris obèses/diabétiques que trois extraits de plantes présentaient des effets prébiotiques, pour un temps de traitement et à des doses inférieurs à ceux en usage aujourd’hui. Pour Matteo Serino, la question qui se pose est : faut-il revoir le protocole d’administration des prébiotiques ? Ces résultats sont publiés dans Molecular Nutrition & Food Research.

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The story outlined in our latest Nature Communications paper (https://www.nature.com/articles/s41467-019-11140-w) began from previous work in the lab (Pathophysiology of intestinal epithelium, Institute of Digestive Health Research, Toulouse, France) demonstrating that thrombin activity was released by healthy human colonic biopsy ex vivo.  

​The full picture now started to get a frame: epithelium continuously produces thrombin as active protease, which cleaves matrix-associated protein of biofilms, a function that help to shape a normal microbiota biogeography at the mucosal surface of the intestine.  Epithelial thrombin is a thus major player of mucosal homeostasis.  Nevertheless, having proposed a new link between epithelial proteases and microbiota might generate future exciting studies, as we found in the lab that intestinal epithelium is the source of few other serine proteases.  We also expect this study to have a strong impact beyond the gastrointestinal tract as we detected thrombin not only in gut epithelia, but also epithelium from the bladder, lungs and skin!  Truly fascinating!

Link to paper: https://www.nature.com/articles/s41467-019-11140-w

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Camille Petitfils fait sa thèse dans l'équipe 3 de l'IRSD sous la supervision de Nicolas Cénac.  Son sujet de thèse  porte sur Rôle des lipides bactériens dans la douleur viscérale . Le syndrome de l'intestin irritable (SII) est le trouble gastro-intestinal le plus commun. La difficulté d'identifier la cause du SII est un verrou pour le développement de thérapies. Élucider les mécanismes responsables du SII mènerait à l'identification demédicaments spécifiques et permettrait de renforcer la lutte contre ce syndrome délétère. Une dysbiose bactérienne a été décrite chez des patients atteints du SII mais son rôle n’a pas été déterminé. Nous avons démontré que les Escherichia colipeuvent synthétiser une large diversité delipopeptides et d’acides gras longues chaines en fonction de leur fond génétique. Ces lipopeptides et ces acides gras longues chaines sont capables de réguler l'activité des neurones sensitifs et la douleur. L’objectif principal de ce projet de thèse est de transférer l’étude ces lipopeptides et acides gras longues chaines à l’ensemble du microbiote en condition normale et en condition pathologiques chez les patients atteints de SII. 
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