MISSION générale
La plateforme "Organoïdes" de l’IRSD recrée in vitro et en trois dimensions des mini-organes épithéliaux à partir de cellules souches isolées de tissus humains ou murins. Ces structures sont appelées organoïdes.
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Nous effectuons des cultures d’organoïdes de colons et d’iléons issus de tissus humains (collections : COLIC DC-2015-2443 puis actuellement CAPITOL N°RC31/21/0038 en collaboration avec les hôpitaux de Toulouse) sains, inflammatoires (maladie de Crohn, rectocolite hémorragique) ou tumoraux, ainsi qu’à partir de tissus murins.
D’autres modèles cellulaires sont en cours de développement (vessies).
D’autres modèles cellulaires sont en cours de développement (vessies).
MOdèles
Organoïdes colorectaux humains (colon, iléon, caecum)
* sains * pathologiques -maladies inflammatoires chroniques de l'intestin MICI (maladie de crohn, rectocolite hémorragique) - cancers colorectaux (en développement). |
Organoïdes colorectaux murins (colon, iléon, caecum)
* sains * inflammatoires |
Organoïdes de vessies humaines
(en développement). |
Services proposés
- Accès aux différentes biobanques constituées depuis plusieurs années (tissus, cryptes, organoïdes)
- Formation, collaboration ou prestation possibles au niveau des cultures d'organoïdes (L2) : suivis des cultures, immunofluorescences, décongélation, passage, entretien, congélation
- Études d'expression transcriptionnelle et protéique
- Développement et réalisation de protocoles expérimentaux
- Utilisation d'un appareil d'imagerie de criblage à haut contenu (Opera Phenix, Perkin Elmer) : Formations, collaborations ou prestations possibles (acquisitions, analyses) EN SAVOIR PLUS
- Récemment, nous avons eu l’immense honneur de devenir détenteur de la biobanque européenne d’organoïdes de rectum de 47 patients atteints de mucoviscidose grâce à l’organisme « Vaincre La Mucoviscidose » (VLM)
FINANCEMENTS
La plateforme a été financée par la Région Occitanie et par des fonds européens dans le cadre du programme Feder. Elle a été également soutenue par un programme FUI impliquant la Banque Publique d'Investissement, Toulouse Métropole et la région Occitanie. Urosphère, Chromalys et les Hôpitaux de Toulouse sont partenaires de cette plateforme. Les équipements ont été obtenus avec l'aide financière de la Fondation Bettencourt-Schueller, à travers le programme "Coup d’élan pour la recherche".
LABELLISATIOnS et RESEAU
Depuis 2023, la plateforme organoïdes est labellisée IBISA (https://www.ibisa.net/). La labellisation prend en compte l’ouverture de la plateforme aux différents laboratoires académiques et aux entreprises privées, la formation, l’évolution technologique et l’identification d’un personnel dédié à la plateforme avec la mise en place d’une démarche qualité.
Elle fait également partie depuis 2023 du réseau toulousain TRI (Toulouse Réseau Imagerie) avec l’incorporation dans ce réseau de son microscope confocal HCS (Opéra Phenix).
Vous pouvez également retrouver la plateforme organoïdes sur labconnect. (https://lab-connect.univ-toulouse.fr/)
Elle fait également partie depuis 2023 du réseau toulousain TRI (Toulouse Réseau Imagerie) avec l’incorporation dans ce réseau de son microscope confocal HCS (Opéra Phenix).
Vous pouvez également retrouver la plateforme organoïdes sur labconnect. (https://lab-connect.univ-toulouse.fr/)
Publications/remerciements ORGANOIDES
Characterization of Human Colon Organoids From Inflammatory Bowel Disease Patients.
d'Aldebert E, Quaranta M, Sébert M, Bonnet D, Kirzin S, Portier G, Duffas JP, Chabot S, Lluel P, Allart S, Ferrand A, Alric L, Racaud-Sultan C, Mas E, Deraison C, Vergnolle N. Front Cell Dev Biol. 2020 Jun 4;8:363. doi: 10.3389/fcell.2020.00363. eCollection 2020.PMID: 32582690
Thrombin modifies growth, proliferation and apoptosis of human colon organoids: a protease-activated receptor 1- and protease-activated receptor 4-dependent mechanism.
Sébert M, Denadai-Souza A, Quaranta M, Racaud-Sultan C, Chabot S, Lluel P, Monjotin N, Alric L, Portier G, Kirzin S, Bonnet D, Ferrand A, Vergnolle N.Br J Pharmacol. 2018 Sep;175(18):3656-3668. doi: 10.1111/bph.14430. Epub 2018 Aug 7.
PMID: 29959891
Prenatal stress induces changes in PAR2- and M3-dependent regulation of colon primitive cells.
Berger M, Guiraud L, Dumas A, Sagnat D, Payros G, Rolland C, Vergnolle N, Deraison C, Cenac N, Racaud-Sultan C.Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2022 Dec 1;323(6):G609-G626. doi: 10.1152/ajpgi.00061.2022. Epub 2022 Oct 25.PMID: 36283083
Sexual dimorphism in PAR2-dependent regulation of primitive colonic cells.
Noguerol J, Roustan PJ, N'Taye M, Delcombel L, Rolland C, Guiraud L, Sagnat D, Edir A, Bonnart C, Denadai-Souza A, Deraison C, Vergnolle N, Racaud-Sultan C.Biol Sex Differ. 2019 Sep 6;10(1):47. doi: 10.1186/s13293-019-0262-6.PMID: 31492202
Daphnanes diterpenes from the latex of Hura crepitans L. and their PKCζ-dependent anti-proliferative activity on colorectal cancer cells.
Crossay E, Jullian V, Trinel M, Sagnat D, Hamel D, Groppi E, Rolland C, Stigliani JL, Mejia K, Cabanillas BJ, Alric L, Buscail E, El Kalamouni C, Mavingui P, Deraison C, Racaud-Sultan C, Fabre N.Bioorg Med Chem. 2023 Jul 15;90:117366. doi: 10.1016/j.bmc.2023.117366. Epub 2023 Jun 7.PMID: 37329676
Epithelial production of elastase is increased in inflammatory bowel disease and causes mucosal inflammation.
Motta JP, Rolland C, Edir A, Florence AC, Sagnat D, Bonnart C, Rousset P, Guiraud L, Quaranta-Nicaise M, Mas E, Bonnet D, Verdu EF, McKay DM, Buscail E, Alric L, Vergnolle N, Deraison C.Mucosal Immunol. 2021 May;14(3):667-678. doi: 10.1038/s41385-021-00375-w. Epub 2021 Mar 5.PMID: 33674762
Cross-Talk Between the Intestinal Epithelium and Salmonella Typhimurium.
Ménard S, Lacroix-Lamandé S, Ehrhardt K, Yan J, Grassl GA, Wiedemann A.Front Microbiol. 2022 Jun 6;13:906238. doi: 10.3389/fmicb.2022.906238. eCollection 2022.PMID: 35733975. Review. (remerciements)
d'Aldebert E, Quaranta M, Sébert M, Bonnet D, Kirzin S, Portier G, Duffas JP, Chabot S, Lluel P, Allart S, Ferrand A, Alric L, Racaud-Sultan C, Mas E, Deraison C, Vergnolle N. Front Cell Dev Biol. 2020 Jun 4;8:363. doi: 10.3389/fcell.2020.00363. eCollection 2020.PMID: 32582690
Thrombin modifies growth, proliferation and apoptosis of human colon organoids: a protease-activated receptor 1- and protease-activated receptor 4-dependent mechanism.
Sébert M, Denadai-Souza A, Quaranta M, Racaud-Sultan C, Chabot S, Lluel P, Monjotin N, Alric L, Portier G, Kirzin S, Bonnet D, Ferrand A, Vergnolle N.Br J Pharmacol. 2018 Sep;175(18):3656-3668. doi: 10.1111/bph.14430. Epub 2018 Aug 7.
PMID: 29959891
Prenatal stress induces changes in PAR2- and M3-dependent regulation of colon primitive cells.
Berger M, Guiraud L, Dumas A, Sagnat D, Payros G, Rolland C, Vergnolle N, Deraison C, Cenac N, Racaud-Sultan C.Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2022 Dec 1;323(6):G609-G626. doi: 10.1152/ajpgi.00061.2022. Epub 2022 Oct 25.PMID: 36283083
Sexual dimorphism in PAR2-dependent regulation of primitive colonic cells.
Noguerol J, Roustan PJ, N'Taye M, Delcombel L, Rolland C, Guiraud L, Sagnat D, Edir A, Bonnart C, Denadai-Souza A, Deraison C, Vergnolle N, Racaud-Sultan C.Biol Sex Differ. 2019 Sep 6;10(1):47. doi: 10.1186/s13293-019-0262-6.PMID: 31492202
Daphnanes diterpenes from the latex of Hura crepitans L. and their PKCζ-dependent anti-proliferative activity on colorectal cancer cells.
Crossay E, Jullian V, Trinel M, Sagnat D, Hamel D, Groppi E, Rolland C, Stigliani JL, Mejia K, Cabanillas BJ, Alric L, Buscail E, El Kalamouni C, Mavingui P, Deraison C, Racaud-Sultan C, Fabre N.Bioorg Med Chem. 2023 Jul 15;90:117366. doi: 10.1016/j.bmc.2023.117366. Epub 2023 Jun 7.PMID: 37329676
Epithelial production of elastase is increased in inflammatory bowel disease and causes mucosal inflammation.
Motta JP, Rolland C, Edir A, Florence AC, Sagnat D, Bonnart C, Rousset P, Guiraud L, Quaranta-Nicaise M, Mas E, Bonnet D, Verdu EF, McKay DM, Buscail E, Alric L, Vergnolle N, Deraison C.Mucosal Immunol. 2021 May;14(3):667-678. doi: 10.1038/s41385-021-00375-w. Epub 2021 Mar 5.PMID: 33674762
Cross-Talk Between the Intestinal Epithelium and Salmonella Typhimurium.
Ménard S, Lacroix-Lamandé S, Ehrhardt K, Yan J, Grassl GA, Wiedemann A.Front Microbiol. 2022 Jun 6;13:906238. doi: 10.3389/fmicb.2022.906238. eCollection 2022.PMID: 35733975. Review. (remerciements)
PUBLICATIONS/remerciements OPERA PHENIX
Metrics of 2D immunological synapses in human T cells via high-content confocal cell imaging
Guilhèn Prunier, Beatriz Chaves, Claire Lacouture, Loïc Dupré
DOI: 10.1016/bs.mcb.2022.07.013
Kinetic measurements of human CD8+ T cell cytotoxic activity in a 384-well plate format
Claire Lacouture, Guilhèn Prunier, Loïc Dupré
DOI: 10.1016/bs.mcb.2022.07.014
Morphological profiling of human T and NK lymphocytes by high-content cell imaging.
German Y, Vulliard L, Kamnev A, Pfajfer L, Huemer J, Mautner AK, Rubio A, Kalinichenko A, Boztug K, Ferrand A, Menche J, Dupré L. Cell Rep. 2021 Jul 6;36(1):109318. doi : 10.1016/j.celrep.2021.109318.PMID: 34233185
Guilhèn Prunier, Beatriz Chaves, Claire Lacouture, Loïc Dupré
DOI: 10.1016/bs.mcb.2022.07.013
Kinetic measurements of human CD8+ T cell cytotoxic activity in a 384-well plate format
Claire Lacouture, Guilhèn Prunier, Loïc Dupré
DOI: 10.1016/bs.mcb.2022.07.014
Morphological profiling of human T and NK lymphocytes by high-content cell imaging.
German Y, Vulliard L, Kamnev A, Pfajfer L, Huemer J, Mautner AK, Rubio A, Kalinichenko A, Boztug K, Ferrand A, Menche J, Dupré L. Cell Rep. 2021 Jul 6;36(1):109318. doi : 10.1016/j.celrep.2021.109318.PMID: 34233185